Las principales funciones de Eixoecologia son las de:
- Asesorar en procesos de diagnóstico y planificación sostenible.
- Investigar y desarrollar nuevos instrumentos para el análisis de ecosistemas territoriales con especial énfasis en los territorios urbanos.
- Desarrollar instrumentos de carácter técnico, económico, legal, de información, etc., que ayuden a incorporar la cultura de la sostenibilidad en las actuaciones diarias de instituciones públicas y privadas y de la ciudadanía en general, tales como: