As principais funções da Eixoecologia são as de:
- Assessorar em processos de diagnóstico e planificação sustentável.
- Investigar e desenvolver novos instrumentos para a análise de ecossistemas territoriais com especial enfase nos territórios urbanos.
- Desenvolver instrumentos de carácter técnico, económico, legal, de informação, etc., que ajudem a incorporar a cultura da sustentabilidade nas ações diárias de instituições públicas e privadas e da cidadania em geral, tais como: